หน้าที่หลักของมอเตอร์เครื่องฟอกอากาศคือ ขับเคลื่อนการไหลเวียนของอากาศด้วยการติดตั้งระบบจ่ายอากาศภายใน (ระบบพลวัตอากาศ) ไว้ในตัวเครื่อง เครื่องฟอกอากาศจะดูดอากาศเสียภายในอาคารเข้าสู่ตัวเครื่อง หลังจากกรองอากาศผ่านแผ่นกรองแล้ว อากาศสะอาดจะถูกปล่อยออก ก่อให้เกิดกระบวนการ “ดูด – กรอง – ปล่อย” ที่เป็นวัฏจักร ท้ายที่สุดแล้ว กระบวนการนี้จะทำให้อากาศภายในอาคารบริสุทธิ์ขึ้น ฟังก์ชันหลักนี้จะกำหนดประสิทธิภาพการฟอกอากาศ ระดับการใช้พลังงาน การควบคุมเสียงรบกวน และอายุการใช้งานของเครื่องฟอกอากาศโดยตรง จึงเป็นองค์ประกอบสำคัญที่ส่งผลต่อประสิทธิภาพโดยรวมของอุปกรณ์
จากมุมมองของประสิทธิภาพการฟอก ปริมาณอากาศและประสิทธิภาพแรงดันอากาศ ของมอเตอร์เป็นปัจจัยหลักที่มีอิทธิพล ปริมาณอากาศเป็นตัวกำหนดปริมาณอากาศที่เครื่องฟอกอากาศสามารถกรองได้ต่อหน่วยเวลา ยิ่งปริมาณอากาศมาก พื้นที่การฟอกอากาศของอุปกรณ์ก็จะกว้างขึ้น และอัตราการเจือจางสารมลพิษ เช่น ฟอร์มาลดีไฮด์และ PM2.5 ก็จะยิ่งเร็วขึ้น ในทางกลับกัน แรงดันอากาศจะส่งผลต่อความสามารถในการไหลเวียนของอากาศผ่านตะแกรงกรอง เมื่อตะแกรงกรองสะสมฝุ่นหลังจากใช้งานไประยะหนึ่ง แรงดันอากาศที่ไม่เพียงพอจะขัดขวางการไหลเวียนของอากาศ แม้ว่าตะแกรงกรองจะยังคงมีประสิทธิภาพการกรองที่ดี แต่ประสิทธิภาพการฟอกอากาศก็จะลดลงอย่างมาก ตัวอย่างเช่น เครื่องฟอกอากาศที่ใช้มอเตอร์ DC แบบไร้แปรงถ่านมักจะสามารถปรับปริมาณอากาศและความดันอากาศได้อย่างแม่นยำ เมื่อต้องใช้งานในห้องนอนขนาด 15-30 ตารางเมตร เครื่องฟอกอากาศจะสามารถปรับปริมาณอากาศได้โดยอัตโนมัติที่ 300-500 ลูกบาศก์เมตรต่อชั่วโมงตามความเข้มข้นของสารมลพิษ ทำให้มั่นใจได้ว่าความเข้มข้นของ PM2.5 จะลดลงจากค่าที่สูงเกินไปให้ต่ำกว่ามาตรฐานความปลอดภัยภายใน 30 นาที ในทางตรงกันข้าม มอเตอร์ AC คุณภาพต่ำจะมีช่วงการปรับปริมาณอากาศที่แคบ ซึ่งอาจนำไปสู่ปัญหาต่างๆ เช่น "ปริมาณอากาศในพื้นที่เล็กๆ มากเกินไป ส่งผลให้สิ้นเปลืองพลังงาน และปริมาณอากาศในพื้นที่ขนาดใหญ่ไม่เพียงพอ ส่งผลให้การฟอกอากาศล่าช้า"
ในแง่ของประสบการณ์ผู้ใช้ การควบคุมเสียงและประสิทธิภาพการใช้พลังงาน ของมอเตอร์มีความสำคัญอย่างยิ่ง เครื่องฟอกอากาศส่วนใหญ่มักใช้ในพื้นที่ปิด เช่น ห้องนอนและห้องทำงาน เสียงที่เกิดจากมอเตอร์ขณะทำงานส่งผลโดยตรงต่อการพักผ่อนหรือการทำงานของผู้ใช้ มอเตอร์ DC แบบไร้แปรงถ่านสามารถลดเสียงรบกวนขณะทำงานให้ต่ำถึง 25 เดซิเบล (เทียบเท่าเสียงกระซิบ) ด้วยการปรับปรุงโครงสร้างโรเตอร์และการออกแบบวงจรแม่เหล็ก แม้จะทำงานด้วยความเร็วต่ำในเวลากลางคืนก็ไม่รบกวนการนอนหลับ อย่างไรก็ตาม เนื่องจากแรงเสียดทานของโรเตอร์ในมอเตอร์ AC ทั่วไปที่สูง เสียงจึงอาจดังเกิน 40 เดซิเบลเมื่อทำงานด้วยความเร็วต่ำ ซึ่งอาจทำให้เกิดความรู้สึกไม่สบายหลังจากใช้งานเป็นเวลานาน ในด้านการใช้พลังงาน มอเตอร์ DC แบบไร้แปรงถ่านมีประสิทธิภาพการแปลงพลังงานไฟฟ้าสูงกว่า 85% เมื่อเทียบกับมอเตอร์ AC ที่มีประสิทธิภาพการแปลงเพียงประมาณ 60% เมื่อทำงานตลอด 24 ชั่วโมง สามารถประหยัดไฟฟ้าได้ประมาณ 5-8 กิโลวัตต์ชั่วโมงต่อเดือน ซึ่งช่วยลดค่าไฟฟ้าได้อย่างมากในระยะยาว
นอกจากนี้แล้ว ความเสถียรและความทนทาน ปัจจัยภายในมอเตอร์ยังส่งผลต่ออายุการใช้งานของเครื่องฟอกอากาศอีกด้วย มอเตอร์คุณภาพสูงใช้ตลับลูกปืนความแม่นยำสูงและคอยล์ทนความร้อนสูง ซึ่งสามารถรักษาประสิทธิภาพการทำงานให้คงที่ตลอดการทำงาน โดยมีอายุการใช้งาน 8,000-10,000 ชั่วโมง (หากใช้งานวันละ 8 ชั่วโมง จะสามารถใช้งานได้นาน 3-4 ปี) อย่างไรก็ตาม เนื่องจากชิ้นส่วนต่างๆ ในมอเตอร์คุณภาพต่ำมีคุณภาพต่ำ ปัญหาต่างๆ เช่น ความเร็วรอบลดลงและเสียงดังขึ้นอาจเกิดขึ้นหลังจากใช้งานไป 1-2 ปี ซึ่งไม่เพียงแต่ส่งผลต่อประสิทธิภาพการฟอกอากาศเท่านั้น แต่ยังจำเป็นต้องเปลี่ยนมอเตอร์ใหม่เพื่อใช้งานต่อ ซึ่งทำให้ต้นทุนการบำรุงรักษาสูงขึ้น



